Team Foundation Server のtfコマンドですが、お使いの Visual Studio 2017 Enterprise バージョンの場合は下記のフォルダにあります。
C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio\2017\Enterprise\Common7\IDE\CommonExtensions\Microsoft\TeamFoundation\Team Explorer
ここに移動もしくはPATHが通るようにし、
tf workspace /delete
と入力して実行すればサーバーに登録されているワークスペースを削除することができます。
ワークスペースを移動などした際に「既に存在します」などのエラーが出たときに試してください。